RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE12FP0CL80 117 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE12GP0CL81 117 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE12IP0CL82 117 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM17P0DL12 118 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE4Q13068 117 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE6HQ13956 83 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 PRELID3AQ96N28 172 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 RABAC1Q9UI14 185 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.27□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 SMKR1H3BMG3 65 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 SPINK8P0C7L1 97 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 COX8AP10176 69 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF415Q09FC8 603 aa9.26□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.26□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00694P0DN24 101 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 CACNG7P62955 275 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 STHQ8IWL8 128 aa9.24□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 U3KQK5 164 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 C7orf71A4D174 169 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF688P0C7X2 276 aa9.22□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 MT-ATP8P03928 68 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-209ENST00000607882 EMP1P54849 157 aa9.21□□□□□ -0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB135Q30KP9 77 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 LYSTQ99698 3801 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EMT4 169 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGEF1-209ENST00000607882 C18orf15Q96N68 181 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 KNCNA6PVL3 124 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 ERCC8Q13216 396 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF575Q86XF7 245 aa9.19□□□□□ -0.94
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RABGEF1-209ENST00000607882 RNF185Q96GF1 192 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 C9JAW5 83 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 F6UB75 175 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 BUB3O43684 328 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 LEPP41159 167 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BUT2 72 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM236CP0DP71 79 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 KIR3DS1Q14943 382 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 DCANP1Q8TF63 244 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB37Q96AX2 223 aa9.15□□□□□ -0.95
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