RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595194.1

GTPBP3-208, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-208	ENST00000595194	C11orf52	Q96A22	123 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-208	ENST00000595194	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC01620	Q4KN68	170 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-208	ENST00000595194	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	RAB5C	P51148	216 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	MPV17L2	Q567V2	206 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	CENPW	Q5EE01	88 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	ENHO	Q6UWT2	76 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	CRP	P02741	224 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	VAX2	Q9UIW0	290 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	GZMB	P10144	247 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	PKIA	P61925	76 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	GNG4	P50150	75 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	SULT1A2	P50226	295 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	C14orf177	Q52M58	125 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	SCX	Q7RTU7	201 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	SMIM12	Q96EX1	92 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GTPBP3-208	ENST00000595194	PDE6D	O43924	150 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	MGP	P08493	103 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	MIA	Q16674	131 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194		M0QY20	66 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	IFNA1	P01562	189 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	CACNG7	P62955	275 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194		H7C1H1	209 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194		P01737	135 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	RBX1	P62877	108 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	GAGE6	Q13070	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194		F2Z2F3	143 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	PRR34	Q9NV39	138 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	USP17L23	D6RBM5	183 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	BCL2	P10415	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	SLC51B	Q86UW2	128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GTPBP3-208	ENST00000595194	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194		J3QL48	77 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	NTF3	P20783	257 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	NUDT11	Q96G61	164 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	PRSS1	P07477	247 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	NIT2	Q9NQR4	276 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	REG3A	Q06141	175 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	TMEM243	Q9BU79	118 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	CTRL	P40313	264 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194		A0A1B0GUV1	79 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	TWIST1	Q15672	202 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GTPBP3-208	ENST00000595194	OCC1	Q8TAD7	63 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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