RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFB1P0C5Y9 115 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01559Q495D7 138 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MPV17L2Q567V2 206 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L23D6RBM5 183 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 CRPP02741 224 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FHITP49789 147 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF674Q2M3X9 581 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10G8Q8NGN5 311 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MBD3L1Q8WWY6 194 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DQA1P01909 254 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD7Q86VX2 200 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 FMC1Q96HJ9 113 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGP03950 147 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2G1P62253 170 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB19A4D1S5 217 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS1P07477 247 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LTAP01374 205 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SFT2D1Q8WV19 159 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB4BP61018 213 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF56Q15929 161 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR27Q6MZM9 219 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PANO1I0J062 215 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CHCHD5Q9BSY4 110 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 MIAQ16674 131 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCC3Q6UW78 93 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf163Q8N9P6 203 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10AG1Q8NH19 301 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1G1O75348 118 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM210AQ96ND0 272 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR34Q9NV39 138 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA1P01562 189 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MT1HL1P0DM35 61 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1C3P42330 323 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CST9LP1Q5W188 147 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SMDT1Q9H4I9 107 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GV50 99 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PKIAP61925 76 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RBX1P62877 108 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SDIM1Q6ZPB5 146 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00269Q8N2A0 174 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MANBALQ9NQG1 85 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL20P78556 96 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE6Q13070 117 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PEA15Q15121 130 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 VAX2Q9UIW0 290 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAI2O43623 268 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL1P09341 107 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A1P23297 94 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H697 171 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2P10415 239 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 DERL1Q9BUN8 251 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG13Q9P2W3 67 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PAGE4O60829 102 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SSTP61278 116 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5AL1P0C617 328 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZRU5 148 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MLST8Q9BVC4 326 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SCO2A0A1W2PP80 73 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CLRN3Q8NCR9 226 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 CNBPP62633 177 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCJQ1A5X6 159 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 REG3AQ06141 175 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BAGE2Q86Y30 109 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 hDV102S1A0JD36 115 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM218A2RU14 115 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM17P0DL12 118 aa16.31■□□□□ 0.2
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