RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 SMKR1H3BMG3 65 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 RS1O15537 224 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 SMIM6P0DI80 62 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 Q8N8P6 123 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 RHODO00212 210 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 GAS8-AS1O95177 125 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 LY6G6CO95867 125 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 NCR2O95944 276 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 HTN1P15515 57 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 AMTP48728 403 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 RRN3P1Q2M238 152 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 FA2HQ7L5A8 372 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 JPT2Q9H910 190 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 M0QY20 66 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 PRM2P04554 102 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 H7C1H1 209 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZWC4 215 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 C18orf15Q96N68 181 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 A0A087WWL8 130 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 MGPP08493 103 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 PYY3Q5JQD4 70 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 NIT2Q9NQR4 276 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 X6R8D5 127 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 VCYO14598 125 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-53P01767 116 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 ST20Q9HBF5 79 aa8.51□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 A0A096LNJ9 63 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 LINC01549A6NIU2 74 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 F5H697 171 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 LEPROTL1O95214 131 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 FCER1GP30273 86 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 RNF183Q96D59 192 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.5□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TCAPO15273 167 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 HBDP02042 147 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 G0S2P27469 103 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 LAGE3Q14657 143 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 ZNF56Q15929 161 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 MIFP14174 115 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZTI0 123 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 C12orf57Q99622 126 aa8.48□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 LYRM9A8MSI8 78 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 C3orf79P0CE67 100 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 PKHD1P08F94 4074 aa8.47□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.46□□□□□ -1.05
GGA3-217ENST00000583667 PET117Q6UWS5 81 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZSN1 163 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 Q8N976 141 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 SPATA25Q9BR10 227 aa8.46□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 I3L3M4 83 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 RHOHQ15669 191 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 PMCHL1Q16048 86 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 OR11H2Q8NH07 326 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 ZNF479Q96JC4 524 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DL4Q99706 377 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.45□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 ATP5LO75964 103 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 KRTDAPP60985 99 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 DEFB135Q30KP9 77 aa8.44□□□□□ -1.06
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