RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLC6P0CF74 106 aa7.69□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 MPV17L2Q567V2 206 aa7.69□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 RMI2Q96E14 147 aa7.69□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.69□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.68□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.68□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM262E9PQX1 116 aa7.68□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 GZMBP10144 247 aa7.68□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 SSTP61278 116 aa7.68□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 ELOBQ15370 118 aa7.68□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 SCXQ7RTU7 201 aa7.68□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB19A4D1S5 217 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 M0QY20 66 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 PFDN1O60925 122 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 Q0VG73 95 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF56Q15929 161 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR34Q9NV39 138 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 GNG13Q9P2W3 67 aa7.67□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.66□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 CENPWQ5EE01 88 aa7.66□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.66□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.66□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 F5H697 171 aa7.65□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 SULT1A2P50226 295 aa7.65□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 RBX1P62877 108 aa7.65□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.65□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 MANBALQ9NQG1 85 aa7.65□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB5CP51148 216 aa7.64□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 IQCJQ1A5X6 159 aa7.64□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.64□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.64□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.64□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 USP17L23D6RBM5 183 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 PRSS1P07477 247 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE6Q13070 117 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 MIAQ16674 131 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 AP1S3Q96PC3 154 aa7.63□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM12Q96EX1 92 aa7.62□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 PANO1I0J062 215 aa7.61□□□□□ -1.19
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CLSTN3-211ENST00000541667 CACNG7P62955 275 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 NUDT11Q96G61 164 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 MED9Q9NWA0 146 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.61□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 F2Z2F3 143 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 PDE6DO43924 150 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 CRPP02741 224 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 SLPIP03973 132 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 BCL2P10415 239 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 PKIAP61925 76 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 C14orf177Q52M58 125 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR73Q6P4I2 378 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 TPPP3Q9BW30 176 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 CNFNQ9BYD5 112 aa7.6□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GUV1 79 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 K7EN84 100 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 P01737 135 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 MGPP08493 103 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 CTRLP40313 264 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 RASL11AQ6T310 242 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC51BQ86UW2 128 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 OCC1Q8TAD7 63 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 NIT2Q9NQR4 276 aa7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CLSTN3-211ENST00000541667 H7C1H1 209 aa7.58□□□□□ -1.2
CLSTN3-211ENST00000541667 J3QL48 77 aa7.58□□□□□ -1.2
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