RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 TFF1P04155 84 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 PMS2P3Q13401 168 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALX1Q15699 326 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 MORN4Q8NDC4 146 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 USMG5Q96IX5 58 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM92AA1XBS5 289 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 COX5BP10606 129 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPCS2Q15005 226 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIAA0556O60303 1618 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD109Q6YHK3 1445 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 PARP14Q460N5 1801 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A087WUJ7 227 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa-3.53□□□□□ -2.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 CARD19Q96LW7 228 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 FKBP11Q9NYL4 201 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-3.53□□□□□ -2.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 BANF1O75531 89 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 OGNP20774 298 aaKnown RBP-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR5H6Q8NGV6 325 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 DLC1Q96QB1 1528 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-3.55□□□□□ -2.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FABP12A6NFH5 140 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A4P12235 298 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 CKS2P33552 79 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q6JHZ5 121 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL20Q9NYY1 176 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 S4R3F8 94 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SSSCA1O60232 199 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A6P12236 298 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-3.56□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-3.57□□□□□ -2.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 BLCAPP62952 87 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC25A26Q70HW3 274 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP-3.57□□□□□ -2.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC179H3BU77 68 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 AIPO00170 330 aa-3.58□□□□□ -2.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 UBE2D2P62837 147 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 OTOSQ8NHW6 89 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 RTL8AQ9BWD3 113 aa-3.58□□□□□ -2.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 CFAP54Q96N23 3096 aa-3.58□□□□□ -2.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 PIRTP0C851 137 aa-3.6□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYBAP13498 195 aa-3.6□□□□□ -2.99
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RNU6-162P-201ENST00000516228 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-3.6□□□□□ -2.99
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RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRC37A3O60309 1634 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP-3.61□□□□□ -2.99
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RNU6-162P-201ENST00000516228 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-3.61□□□□□ -2.99
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RNU6-162P-201ENST00000516228 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHB2Q99623 299 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 UFC1Q9Y3C8 167 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 F8VRH5 84 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 NDUFC2O95298 119 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-162P-201ENST00000516228 MT1FP04733 61 aa-3.62□□□□□ -2.99
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