RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 RS1O15537 224 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MRAP2Q96G30 205 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 CELA1Q9UNI1 258 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.9□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R17O96001 155 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 PPBPP02775 128 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 RAB5AP20339 215 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 EVI2AP22794 236 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 SLAQ13239 276 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 YPEL4Q96NS1 127 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 MUC4Q99102 2169 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-53P01767 116 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 APCSP02743 223 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 FHL2Q14192 279 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 RHOHQ15669 191 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 AMN1Q8IY45 258 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 K7EQD1 137 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 CRYGDP07320 174 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 ORMDL3Q8N138 153 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF479Q96JC4 524 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.87□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 FBN3Q75N90 2809 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 COLCA2A8K830 154 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 HTN3P15516 51 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 CKS2P33552 79 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 C12orf74Q32Q52 190 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZTC4 211 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 JPT2Q9H910 190 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 PRO0255Q9UI72 69 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 D6R8Y8 96 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 F5H768 121 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 PHOX2AO14813 284 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 RAB4AP20338 218 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 TENM3Q9P273 2699 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 RNF185Q96GF1 192 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-211ENST00000497210 NACAE9PAV3 2078 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 NUPR2A6NF83 97 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 H3BNG1 76 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 NCR2O95944 276 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 CRYBA4P53673 196 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 PRELID3AQ96N28 172 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 NIT2Q9NQR4 276 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 COL7A1Q02388 2944 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 M0QY20 66 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TCAPO15273 167 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TRGC2P03986 189 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 PMCHP20382 165 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 SRIP30626 198 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00315P59091 139 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf78Q9BR46 151 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 ST20Q9HBF5 79 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.82□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 SMKR1H3BMG3 65 aa6.81□□□□□ -1.32
CTPS1-211ENST00000497210 SLPIP03973 132 aa6.81□□□□□ -1.32
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