RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 C9orf85Q96MD7 179 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 DEC1Q9P2X7 70 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 UNC13CQ8NB66 2214 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 EML6Q6ZMW3 1958 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 TET1Q8NFU7 2136 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 TRANK1O15050 2925 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0B4J2C4 111 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0J9YY99 117 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 UPK2O00526 184 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHV3-30P01768 117 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHG2P01859 326 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 SYNJ2BPP57105 145 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 CCL8P80075 99 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 PRCDQ00LT1 54 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 LAGE3Q14657 143 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL39P5Q59GN2 51 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 Q8IYB0 196 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF185Q96GF1 192 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 METTL26Q96S19 204 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 UPK3BQ9BT76 320 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM14BQ9NUH8 114 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-210ENST00000485459 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 USP34Q70CQ2 3546 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 ESPL1Q14674 2120 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFHX4Q86UP3 3567 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 CACNA1DQ01668 2161 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 DMDP11532 3685 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0U1RQV1 116 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SH2D1AO60880 128 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 COX6B1P14854 86 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 CRIP1P50238 77 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SERP2Q8N6R1 65 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM75Q8N9X5 138 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 USF3Q68DE3 2245 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 NCOR1O75376 2440 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 CEP192Q8TEP8 1941 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 K7EMT4 169 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 NDUFC2O95298 119 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 NPC2P61916 151 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 ERCC8Q13216 396 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00311Q8N616 119 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SRXN1Q9BYN0 137 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC6Q6W4X9 2439 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 MYO7AQ13402 2215 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHV3-48P01763 117 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHV3-9P01782 118 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TFF1P04155 84 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 COX6CP09669 75 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 VMA21Q3ZAQ7 101 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR86Q86TI4 376 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM243Q9BU79 118 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM14CQ9P0S9 112 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 DPM3Q9P2X0 92 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 KNTC1P50748 2209 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-210ENST00000485459 LRP4O75096 1905 aa2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.1 ms