RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 HIGD1CA8MV81 97 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 TWIST1Q15672 202 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 TPPP3Q9BW30 176 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 NIT2Q9NQR4 276 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GUT8 65 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 F5H697 171 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF56Q15929 161 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GVY2 172 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GW15 77 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 PPP1R2P9O14990 202 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 ADIRFQ15847 76 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 RASL11AQ6T310 242 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 NFE4Q86UQ8 179 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 NUP35Q8NFH5 326 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00862A6NCI5 91 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 BORCS7Q96B45 105 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM218A2RU14 115 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 SSTP61278 116 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 RIGQ13278 110 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 LAGE3Q14657 143 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 NIT1Q86X76 327 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 GATD1Q8NB37 220 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 SEC11CQ9BY50 192 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 RAB4AP20338 218 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 PKIAP61925 76 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 IQCJQ1A5X6 159 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 RNF185Q96GF1 192 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 IMMP2LQ96T52 175 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 PPP1R17O96001 155 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 MT-ND4LP03901 98 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 ELOBQ15370 118 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GUV1 79 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 NCR2O95944 276 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 S100A8P05109 93 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 MGPP08493 103 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
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HDLBP-240ENST00000484412 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GXF2 115 aa9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 H7C423 109 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 ADCYAP1P18509 176 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 TNP2Q05952 138 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 COX11Q9Y6N1 276 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 F8W036 122 aa9.36□□□□□ -0.91
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HDLBP-240ENST00000484412 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 Q0VG73 95 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 AMN1Q8IY45 258 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 TM2D2Q9BX73 214 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 PRSS47A8MTI9 375 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 I3L3M4 83 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 PHOX2AO14813 284 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV3-30P01768 117 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV3-33P01772 117 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 PPBPP02775 128 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 HBBP68871 147 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 COTL1Q14019 142 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 COMMD7Q86VX2 200 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 PRR34Q9NV39 138 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-240ENST00000484412 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.33□□□□□ -0.92
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