RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220		P01737	135 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	KLK12	Q9UKR0	248 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220		F5H697	171 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220		M0QY20	66 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	ATRAID	Q6UW56	229 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	NUDT11	Q96G61	164 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220	TPPP3	Q9BW30	176 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNHG12-208	ENST00000481220		F2Z2F3	143 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220		K7EN84	100 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	SMIM17	P0DL12	118 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	CACNG7	P62955	275 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	OCC1	Q8TAD7	63 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	BIN3	Q9NQY0	253 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	COX11	Q9Y6N1	276 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A087WX48	190 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	XKRY2	A2RUG3	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	CTRL	P40313	264 aa		12	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	BLOC1S1	P78537	153 aa		12	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	ELOB	Q15370	118 aa		12	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	WDR73	Q6P4I2	378 aa		12	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	BAALC	Q8WXS3	180 aa		12	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	CNFN	Q9BYD5	112 aa		12	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		12	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM250	H0YL14	139 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	LECT2	O14960	151 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	NTF3	P20783	257 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	ENHO	Q6UWT2	76 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A1B0GVG6	124 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	RMI2	Q96E14	147 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	EPM2A	B3EWF7	344 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	MGP	P08493	103 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220		Q0VG73	95 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220		Q8N976	141 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	GTSF1	Q8WW33	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SNHG12-208	ENST00000481220		H7C1H1	209 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	PKIA	P61925	76 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	HAMP	P81172	84 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	RASL11A	Q6T310	242 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220		Q6ZSA8	131 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	RBX1	P62877	108 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220		Q5VSD8	79 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	TWIST1	Q15672	202 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	GAGE6	Q13070	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	MIA	Q16674	131 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SNHG12-208	ENST00000481220	CRP	P02741	224 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC01620	Q4KN68	170 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	FRZB	Q92765	325 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	CEBPG	P53567	150 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	CT83	Q5H943	113 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A1B0GUV1	79 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220		A8MWL6	223 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SNHG12-208	ENST00000481220	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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