RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WTM6 91 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 M0QY20 66 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 EREGO14944 169 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TWIST1Q15672 202 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 LINC01551Q86U37 167 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 NIT1Q86X76 327 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 Q9HAA7 133 aa6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 A8MWL6 223 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 C9JQL5 133 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 H7C1H1 209 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 PSCAO43653 123 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 PEA15Q15121 130 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 CNFNQ9BYD5 112 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.13□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 HERC2O95714 4834 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WX48 190 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TMEM262E9PQX1 116 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 PKHD1P08F94 4074 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 LAGE3Q14657 143 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 CT83Q5H943 113 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 RASL11AQ6T310 242 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 OSTCQ9NRP0 149 aa6.12□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TSKUQ8WUA8 353 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TM2D2Q9BX73 214 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 NIT2Q9NQR4 276 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 KLK12Q9UKR0 248 aa6.11□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 ELOBQ15370 118 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 GATD1Q8NB37 220 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 ISOC2Q96AB3 205 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 BORCS7Q96B45 105 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 NAT8Q9UHE5 227 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 V9GYV3 84 aa6.1□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 FAM231BA6NCW3 169 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 HIGD1CA8MV81 97 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 ADIRFQ15847 76 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 MPV17L2Q567V2 206 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 FRZBQ92765 325 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 UBE2WQ96B02 151 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 RYR1P21817 5038 aa6.09□□□□□ -1.43
SYN3-211ENST00000472027 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GUT8 65 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 CDK2AP2O75956 126 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 PKIAP61925 76 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 GAGE6Q13070 117 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 IQCJQ1A5X6 159 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 ENHOQ6UWT2 76 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 Q8N814 137 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 Q8N976 141 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 COX11Q9Y6N1 276 aa6.08□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 RAB14P61106 215 aa6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 RBX1P62877 108 aa6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 Q0VG73 95 aa6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 NUP35Q8NFH5 326 aa6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 RMI2Q96E14 147 aa6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.07□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 LECT2O14960 151 aa6.06□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 RAB4AP20338 218 aa6.06□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 RIGQ13278 110 aa6.06□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 COTL1Q14019 142 aa6.06□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 WFDC2Q14508 124 aa6.06□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 BAALCQ8WXS3 180 aa6.06□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 RNF185Q96GF1 192 aa6.06□□□□□ -1.44
SYN3-211ENST00000472027 TMEM243Q9BU79 118 aa6.06□□□□□ -1.44
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