RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 FAIMQ9NVQ4 179 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SERP1Q9Y6X1 66 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 MED13LQ71F56 2210 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NSD3Q9BZ95 1437 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 IFITM1P13164 125 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 C9orf153Q5TBE3 101 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC48A1Q6P1K1 146 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC9CQ8N5M4 171 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SNHG12Q9BXW3 62 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM242Q9NWH2 141 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 V9GYS6 101 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCA1O95477 2261 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 MCRIP1C9JLW8 97 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 IL5P05113 134 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SPINK8P0C7L1 97 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CAV3P56539 151 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6AWC8 147 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 AQP10Q96PS8 301 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 DOCK1Q14185 1865 aa1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC18Q5T9S5 1454 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PIPP12273 146 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NPC2P61916 151 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 C12orf73Q69YU5 71 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 C10orf99Q6UWK7 81 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZS92 163 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 C9orf62Q8N4C0 152 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TSKUQ8WUA8 353 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SPTSSAQ969W0 71 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM141Q96I45 108 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 AP4S1Q9Y587 144 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRL2O95490 1459 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM24AA6NFZ4 105 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM262E9PQX1 116 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SNCGO76070 127 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFB6O95139 128 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MPC2O95563 127 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCA3Q99758 1704 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PARP14Q460N5 1801 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 WNK3Q9BYP7 1800 aa1.45□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FYCO1Q9BQS8 1478 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NRXN2Q9P2S2 1712 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 K7EIL1 84 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00032P0C843 101 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 UBA52P62987 128 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DPY30Q9C005 99 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TCHHQ07283 1943 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MED14O60244 1454 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MYH8P13535 1937 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 OOSP1A8MZH6 123 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF56Q15929 161 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 C4orf33Q8N1A6 199 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP5Q13017 1502 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TEX14Q8IWB6 1497 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DAPK1P53355 1430 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PPM0 123 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BQ15 152 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2G1P62253 170 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 VAMP8Q9BV40 100 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 GAPVD1Q14C86 1478 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa1.42□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD1O00168 92 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SSSCA1O60232 199 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DCDP81605 110 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KLKP1Q107X0 134 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 C10orf82Q8WW14 230 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PLAC4Q8WY50 150 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCC3O15438 1527 aa1.4□□□□□ -2.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 A6NIN4 97 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 C5orf38Q86SI9 138 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8N8P6 123 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LCN9Q8WX39 176 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 DSCR8Q96T75 97 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SBF2Q86WG5 1849 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-205ENST00000462042 PATJQ8NI35 1801 aa1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms