RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 HSD52Q0P140 79 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZQT7 251 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGEF1-205ENST00000450873 A6NDN8 102 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 H0Y8G0 127 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 H3BRM9 83 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ATOH7Q8N100 152 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 DKK2Q9UBU2 259 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf118A6NHY6 69 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 LYRM9A8MSI8 78 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV2-8P01709 118 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 FA2HQ7L5A8 372 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 CELA1Q9UNI1 258 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ERASQ7Z444 233 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 MLST8Q9BVC4 326 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM231BA6NCW3 169 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SPINK4O60575 86 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 CRIP1P50238 77 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TCL1AP56279 114 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF415Q09FC8 603 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 C12orf74Q32Q52 190 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SH2D1AO60880 128 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPAN13O95857 204 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 DAD1P61803 113 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 GNRH2O43555 120 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ORM1P02763 201 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SPXQ9BT56 116 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 MDFICQ9P1T7 246 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 NUPR2A6NF83 97 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5AL1P0C617 328 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZTC4 211 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GXF2 115 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB130BP0DP73 79 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB130AP0DP74 79 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-205ENST00000450873 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-205ENST00000450873 NUP35Q8NFH5 326 aa7.52□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.52□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.51□□□□□ -1.21
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RABGEF1-205ENST00000450873 GAGE12GP0CL81 117 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 GAGE12IP0CL82 117 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 FABP2P12104 132 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 ASIPP42127 132 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZTI0 123 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 M0R2P5 195 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 LEPROTL1O95214 131 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 COX8AP10176 69 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf85Q96MD7 179 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-205ENST00000450873 C18orf15Q96N68 181 aa7.5□□□□□ -1.21
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