RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 C8orf49Q96NF6 230 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 GPHA2Q96T91 129 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 DKK2Q9UBU2 259 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 Q8TAT8 98 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRD-201ENST00000355233 SMKR1H3BMG3 65 aa3.74□□□□□ -1.81
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PTPRD-201ENST00000355233 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CCKP06307 115 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2D1P51668 147 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PRO0255Q9UI72 69 aa3.73□□□□□ -1.81
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