RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZSN1 163 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 IL17DQ8TAD2 202 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 EREGO14944 169 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 RS1O15537 224 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 INSL3P51460 131 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 STPG4Q8N801 248 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DL4Q99706 377 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.91□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 SNHG12Q9BXW3 62 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.9□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.9□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 ZMAT4Q9H898 229 aa12.9□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.9□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 Q9UF83 564 aa12.9□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 ATRQ13535 2644 aa12.89□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 CYSRT1A8MQ03 144 aa12.89□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 H7C1H1 209 aa12.89□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 TCTAP57738 103 aa12.89□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.89□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.89□□□□□ -0.35
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ACTB-201ENST00000331789 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 M0R143 59 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 TSHBP01222 138 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WX48 190 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 I3L3M4 83 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 RHODO00212 210 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZTI0 123 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 IGKCP01834 107 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 RIPPLY3P57055 190 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 ERASQ7Z444 233 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A34Q6PIV7 304 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 BAALCQ8WXS3 180 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.86□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 DPM2O94777 84 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-53P01767 116 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 G0S2P27469 103 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 OR4C5Q8NGB2 326 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 C16orf74Q96GX8 76 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.85□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 IGIPA6NJ69 53 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 ZNF479Q96JC4 524 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 COX8AP10176 69 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 RHOHQ15669 191 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 RRN3P1Q2M238 152 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.84□□□□□ -0.35
ACTB-201ENST00000331789 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 C2orf88Q9BSF0 95 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 BATFQ16520 125 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa12.82□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 LINC01549A6NIU2 74 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 F8VRH5 84 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 FGF6P10767 208 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 BAHCC1Q9P281 2608 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 GAGE12BA1L429 117 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 GAGE7O76087 117 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 GAGE12FP0CL80 117 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 GAGE12GP0CL81 117 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 GAGE12IP0CL82 117 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 TMEM141Q96I45 108 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 TIMM17AQ99595 171 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.8□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.79□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 PLNP26678 52 aa12.79□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 NMUP48645 174 aa12.79□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.78□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GV90 55 aa12.78□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 EMP1P54849 157 aa12.78□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 PCP2Q8IVA1 136 aa12.78□□□□□ -0.36
ACTB-201ENST00000331789 BOD1L2Q8IYS8 172 aa12.77□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 TRGV2A0A075B6R0 118 aa12.76□□□□□ -0.37
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