RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.29	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.29	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		11.29	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.29	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	LELP1	Q5T871	98 aa		11.28	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.28	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.28	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	EREG	O14944	169 aa		11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR5AL1	P0C617	328 aa		11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SST	P61278	116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.26	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035		P01737	135 aa		11.26	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.26	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		11.26	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.26	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WWC5	75 aa		11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GVG6	124 aa		11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNAI2	O43623	268 aa		11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF56	Q15929	161 aa		11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPPP3	Q9BW30	176 aa		11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035		F5H697	171 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB4B	P61018	213 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.24	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.23	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.23	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	GZMB	P10144	247 aa		11.22	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q9UF83	564 aa		11.22	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSCA	O43653	123 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEBPG	P53567	150 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	CACNG7	P62955	275 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		11.21	□□□□□ -0.61
JMJD1C-211	ENST00000633035	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.2	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035		F2Z2F3	143 aa		11.2	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM250	H0YL14	139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		11.19	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.19	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	OCC1	Q8TAD7	63 aa		11.19	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q9HAA7	133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLC6	P0CF74	106 aa		11.18	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.18	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	MGP	P08493	103 aa		11.17	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2D3	P61077	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2D2	P62837	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.17	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WTM6	91 aa		11.16	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035		H7C1H1	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP10-2	P60368	255 aa		11.16	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.16	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WX48	190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	NTF3	P20783	257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAGE3	Q14657	143 aa		11.15	□□□□□ -0.62
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035		K7EN84	100 aa		11.14	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELOB	Q15370	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.14	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		11.14	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	TWIST1	Q15672	202 aa		11.13	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.13	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.13	□□□□□ -0.63
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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