RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB24Q969Q5 203 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 COX11Q9Y6N1 276 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 RBFOX3A6NFN3 312 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WWC5 75 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2G3Q8NGZ4 309 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8N976 141 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.77■□□□□ 0.28
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CAPNS1-211ENST00000590874 ASIPP42127 132 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB14P61106 215 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 NIT1Q86X76 327 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa16.77■□□□□ 0.28
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CAPNS1-211ENST00000590874 CLLU1Q5K131 121 aa16.76■□□□□ 0.27
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CAPNS1-211ENST00000590874 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FAT3Q8TDW7 4589 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV34A0A0B4J273 112 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 DMRTA1Q5VZB9 504 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 IL36BQ9NZH7 164 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BVH4 76 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1A2P50226 295 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB5CP51148 216 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM167BQ9NRX6 74 aa16.74■□□□□ 0.27
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CAPNS1-211ENST00000590874 SERF2P84101 59 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT8Q8NBV8 401 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FABP5P3A8MUU1 101 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA5Q16718 116 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2WQ96B02 151 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 RHODO00212 210 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 OXTP01178 125 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM74A4Q5TZK3 123 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UBR4Q5T4S7 5183 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 B4DEV8 164 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PRE2 83 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MBP02144 154 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMS2P0C7Q2 107 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ATRAIDQ6UW56 229 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 Q86TA4 180 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WWL8 130 aa16.68■□□□□ 0.26
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CAPNS1-211ENST00000590874 CRIP1P50238 77 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 BLOC1S1P78537 153 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WX48 190 aa16.67■□□□□ 0.26
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SFRP2Q96HF1 295 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX7O00628 323 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2G2P60604 165 aa16.65■□□□□ 0.26
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF726P1Q15940 193 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MED9Q9NWA0 146 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00862A6NCI5 91 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D1AO60880 128 aa16.64■□□□□ 0.25
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CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2D2P62837 147 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R381 172 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 Q0VG73 95 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNIP4Q6PIL6 250 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ENHOQ6UWT2 76 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM213BQ8TBF2 198 aa16.62■□□□□ 0.25
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CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.61■□□□□ 0.25
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CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf43Q9BWL3 253 aa16.61■□□□□ 0.25
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CAPNS1-211ENST00000590874 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf177Q52M58 125 aa16.6■□□□□ 0.25
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CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM74A7A6NL05 159 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM162BQ5T6X4 162 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2BAQ96A08 127 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM262E9PQX1 116 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX46H3BTG2 121 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP82Q8N141 532 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 C15orf54Q8N8G6 183 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.58■□□□□ 0.24
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