RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 GAGE2BQ13066 116 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-205ENST00000587860 GAGE2EQ4V326 116 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-205ENST00000587860 PRR9Q5T870 116 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-205ENST00000587860 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.48□□□□□ -0.57
CTIF-205ENST00000587860 PAX8Q06710 450 aa11.48□□□□□ -0.57
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CTIF-205ENST00000587860 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.43□□□□□ -0.58
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CTIF-205ENST00000587860 LINC01559Q495D7 138 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 DUX3Q96PT4 197 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CTIF-205ENST00000587860 NACAE9PAV3 2078 aa11.34□□□□□ -0.59
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