RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.81□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 PSCAO43653 123 aa7.81□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.81□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.81□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.81□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FMC1Q96HJ9 113 aa7.81□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.8□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.8□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 MLST8Q9BVC4 326 aa7.8□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087WWL8 130 aa7.79□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.79□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 PAGE4O60829 102 aa7.79□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.79□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087WWC5 75 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 RHODO00212 210 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 C1QBP02746 253 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SEC11BP0C7V7 166 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 CST9LP1Q5W188 147 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZSA8 131 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 NIT1Q86X76 327 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FRZBQ92765 325 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TM2D2Q9BX73 214 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.78□□□□□ -1.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GVG6 124 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 HMSDA8MTL9 139 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R381 172 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2D3P61077 147 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2G1P62253 170 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2D2P62837 147 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF345Q14585 488 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SYT8Q8NBV8 401 aa7.77□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 LECT2O14960 151 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 CCL20P78556 96 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR27Q6MZM9 219 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 STOML3Q8TAV4 291 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 BAALCQ8WXS3 180 aa7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 UMAD1C9J7I0 102 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SNAI2O43623 268 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 AKR1C3P42330 323 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ZFP82Q8N141 532 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.75□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GV50 99 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM229AH3BQW9 127 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 CXCL1P09341 107 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01620Q4KN68 170 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TMUB2Q71RG4 321 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 BAGE2Q86Y30 109 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 KLK12Q9UKR0 248 aa7.74□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0D9SG52 128 aa7.73□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 BCL2L11O43521 198 aa7.73□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB4BP61018 213 aa7.73□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TOR2AQ5JU69 321 aa7.73□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ENHOQ6UWT2 76 aa7.73□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.73□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV2-8P01709 118 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5AL1P0C617 328 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 COX11Q9Y6N1 276 aa7.72□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.71□□□□□ -1.17
CLSTN3-211ENST00000541667 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.71□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 C11orf52Q96A22 123 aa7.71□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2WQ96B02 151 aa7.71□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 DERL1Q9BUN8 251 aa7.71□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.7□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.7□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.7□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 AKAP14Q86UN6 197 aa7.7□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8N976 141 aa7.7□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 VAX2Q9UIW0 290 aa7.7□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087WX48 190 aa7.69□□□□□ -1.18
CLSTN3-211ENST00000541667 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms