RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 DKK2Q9UBU2 259 aa6.86□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 U3KQE9 123 aa6.86□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 M0R2Z0 102 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 NUPR1O60356 82 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 IGLV2-11P01706 119 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 HLA-DRB4P13762 266 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 RAB4AP20338 218 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 VAMP8Q9BV40 100 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.85□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 A0A087X0K7 114 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 A0A1B0GXF2 115 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 F2Z2F3 143 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 GPX1P07203 203 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 FXYD7P58549 80 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 DEFB1P60022 68 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 C16orf92Q96LL3 132 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 C8orf49Q96NF6 230 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 NRN1Q9NPD7 142 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.84□□□□□ -1.31
NOP56-215ENST00000490753 C20orf202A1L168 122 aa6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 BUB3O43684 328 aa6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 SH2D1AO60880 128 aa6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 IGKV3-20P01619 116 aa6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 C6orf223Q8N319 242 aa6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 GTSF1Q8WW33 167 aa6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 RBAKDNA6NC62 111 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ORM1P02763 201 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 CTAG1AP78358 180 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 FA2HQ7L5A8 372 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ZNF738Q8NE65 137 aa6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 DAD1P61803 113 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 NIT1Q86X76 327 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 Q8TAT8 98 aa6.81□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ZNF138P52744 262 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 LINC00310P59036 64 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 SSTP61278 116 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 TWIST1Q15672 202 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 PMCHL1Q16048 86 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 RNF182Q8N6D2 247 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 VGLL1Q99990 258 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 OR5AL1P0C617 328 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ERCC8Q13216 396 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 RRN3P1Q2M238 152 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.79□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 F6UB75 175 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 SOCS3O14543 225 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 LEPROTL1O95214 131 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 LINC00614P0C842 121 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 C3orf79P0CE67 100 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 ID1P41134 155 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 CRIP1P50238 77 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 KRTAP10-2P60368 255 aa6.78□□□□□ -1.32
NOP56-215ENST00000490753 SPATA45Q537H7 98 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.9 ms