RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424		F2Z2F3	143 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOD	O00212	210 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5AL1	P0C617	328 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TPPP3	Q9BW30	176 aa		11.9	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.89	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EN84	100 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAI2	O43623	268 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG7	P62955	275 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MWL6	223 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SIVA1	O15304	175 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.87	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.86	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GYPE	P15421	78 aa		11.86	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SRI	P30626	198 aa		11.86	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TNP2	Q05952	138 aa		11.86	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOH	Q15669	191 aa		11.86	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.86	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.86	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GZMB	P10144	247 aa		11.85	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TIRAP	P58753	221 aa		11.85	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SST	P61278	116 aa		11.85	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.85	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.85	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		11.85	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	IFITM2	Q01629	132 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ADIRF	Q15847	76 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CT83	Q5H943	113 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	BORCS7	Q96B45	105 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.84	□□□□□ -0.51
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WWL8	130 aa		11.83	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424		C9JQL5	133 aa		11.83	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EQD1	137 aa		11.83	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NXPH4	O95158	308 aa		11.83	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLC6	P0CF74	106 aa		11.83	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.83	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.83	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.82	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.82	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.82	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		11.82	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.82	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	JPT2	Q9H910	190 aa		11.82	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK2AP2	O75956	126 aa		11.81	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB4B	P61018	213 aa		11.81	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCC3	Q6UW78	93 aa		11.81	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.81	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.81	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424		F5H697	171 aa		11.8	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYGD	P07320	174 aa		11.8	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TWIST1	Q15672	202 aa		11.8	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF56	Q15929	161 aa		11.8	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.8	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.8	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.79	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NTF3	P20783	257 aa		11.79	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CTRL	P40313	264 aa		11.79	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.79	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TSKU	Q8WUA8	353 aa		11.79	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.78	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.78	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.78	□□□□□ -0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RYR1	P21817	5038 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C1H1	209 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	EVI2A	P22794	236 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00315	P59091	139 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.77	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.76	□□□□□ -0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.76	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.6 ms