RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.69	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.69	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	IL36B	Q9NZH7	164 aa		6.69	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279		K7EQM0	130 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	TCRB	P04435	133 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	TCRA	P04437	139 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	WDR73	Q6P4I2	378 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	C7orf33	Q8WU49	177 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.68	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	PLA2G10	O15496	165 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	PTTG1	O95997	202 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	CHTF8	P0CG12	524 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	IL7	P13232	177 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	DEFA1	P59665	94 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	DEFA3	P59666	94 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	PKIA	P61925	76 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		6.67	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279		A0A087WWL8	130 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279		A0A1W2PPV4	95 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279		H0YIZ8	118 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	SFRP2	Q96HF1	295 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	NUDT15	Q9NV35	164 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	PRR34	Q9NV39	138 aa		6.66	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	hDV102S1	A0JD36	115 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279		H3BVH4	76 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	LYRM1	O43325	122 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	UPK1B	O75841	260 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APTX-222	ENST00000478279		B4DEV8	164 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	SLPI	P03973	132 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	REG3G	Q6UW15	175 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	AKAP14	Q86UN6	197 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	EPDR1	Q9UM22	224 aa		6.64	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	SIX6	O95475	246 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	RAB2A	P61019	212 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	RBX1	P62877	108 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	SUN5	Q8TC36	379 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	HSPB11	Q9Y547	144 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279		M0R381	172 aa		6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	STAG3L2	P0CL84	134 aa		6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	STAG3L3	P0CL85	134 aa		6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		6.62	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	RAB4B	P61018	213 aa		6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	GAGE6	Q13070	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	ZFP82	Q8N141	532 aa		6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		6.61	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279		M0R036	132 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279		P01737	135 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	GCHFR	P30047	84 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	CRIP1	P50238	77 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	COX6A2	Q02221	97 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	REG3A	Q06141	175 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	MAJIN	Q3KP22	176 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	PRR27	Q6MZM9	219 aa		6.6	□□□□□ -1.35
APTX-222	ENST00000478279	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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