RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GAGE12JA6NER3 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 RHODO00212 210 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SNAI2O43623 268 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SSTP61278 116 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GAGE1Q13065 139 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GAGE4Q13068 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GAGE5Q13069 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GAGE13Q4V321 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 Q9UF83 564 aa6.23□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 OR5AL1P0C617 328 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GZMBP10144 247 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 EVI2AP22794 236 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 LINC00315P59091 139 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 BIN3Q9NQY0 253 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.22□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 K7EP13 123 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 P01737 135 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 LINC00694P0DN24 101 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 LELP1Q5T871 98 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 OCC1Q8TAD7 63 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 NUDT11Q96G61 164 aa6.21□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 XKRY2A2RUG3 117 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 TMEM250H0YL14 139 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 K7EN84 100 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 IGLC6P0CF74 106 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 RAB4BP61018 213 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 TPPP3Q9BW30 176 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.2□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 PKD1P98161 4303 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 CEBPGP53567 150 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 ZNF56Q15929 161 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 TOR2AQ5JU69 321 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 NFE4Q86UQ8 179 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 FAM210AQ96ND0 272 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.19□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 F2Z2F3 143 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 F5H697 171 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-30P01768 117 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-33P01772 117 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 SMIM17P0DL12 118 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 CACNG7P62955 275 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 TEX261Q6UWH6 196 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WWC5 75 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 NTF3P20783 257 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 UBE2D3P61077 147 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 UBE2D2P62837 147 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 AP1S3Q96PC3 154 aa6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 C16orf90A8MZG2 172 aa6.16□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 WDR73Q6P4I2 378 aa6.16□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.16□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 ZNF727A8MUV8 499 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 MGPP08493 103 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 TRGC1P0CF51 173 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 CTRLP40313 264 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP10-2P60368 255 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 ERVFC1-1P60608 527 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 Q8N3U1 123 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 GTSF1Q8WW33 167 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.15□□□□□ -1.42
SYN3-211ENST00000472027 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.14□□□□□ -1.43
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