RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	NACA	E9PAV3	2078 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	GZMB	P10144	247 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	TIRAP	P58753	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965		Q6ZR54	194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965		Q9H8V8	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965		A0A087WWL8	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	CT83	Q5H943	113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965		Q6ZSN1	163 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965		M0R2N4	97 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	CTRL	P40313	264 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDAC10-208	ENST00000470965	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965		A8MWL6	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965		C9JQL5	133 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	RAB4B	P61018	213 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	CLLU1	Q5K131	121 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	SIVA1	O15304	175 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	OSTC	Q9NRP0	149 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	SST	P61278	116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF56	Q15929	161 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965		K7EP13	123 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GAGE1	Q13065	139 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GAGE4	Q13068	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GAGE5	Q13069	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	NTF3	P20783	257 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	IFITM2	Q01629	132 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HDAC10-208	ENST00000470965		F5H697	171 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	ADIRF	Q15847	76 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	LELP1	Q5T871	98 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	LINC00315	P59091	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965		A0A087WWC5	75 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965		H7C1H1	209 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	TWIST1	Q15672	202 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	C6orf223	Q8N319	242 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965		V9GYV3	84 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	EVI2A	P22794	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965		Q9UF83	564 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	RTL8C	O15255	209 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	MGP	P08493	103 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	UBE2D3	P61077	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	UBE2D2	P62837	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HDAC10-208	ENST00000470965	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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