RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445108.5

ARID4A-208, Transcript of AT-rich interaction domain 4A, human

TSL 3

Gene ARID4A, Length 965 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID4A-208	ENST00000445108	TIRAP	P58753	221 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108		Q9UF83	564 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108		P01737	135 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	GZMB	P10144	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	OCC1	Q8TAD7	63 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	GAGE1	Q13065	139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	GAGE4	Q13068	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	GAGE5	Q13069	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	NUDT11	Q96G61	164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ARID4A-208	ENST00000445108	PKD1	P98161	4303 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108		K7EN84	100 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	SST	P61278	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	TNP2	Q05952	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	LINC00315	P59091	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	CEBPG	P53567	150 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	LELP1	Q5T871	98 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	EVI2A	P22794	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	RAB4B	P61018	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108		K7EP13	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108	PKHD1	P08F94	4074 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARID4A-208	ENST00000445108		F2Z2F3	143 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	CACNG7	P62955	275 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	ZNF56	Q15929	161 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108		F5H697	171 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	CTRL	P40313	264 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	UBE2D3	P61077	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	UBE2D2	P62837	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108		A0A087WWC5	75 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	NTF3	P20783	257 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108		C9JQL5	133 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ARID4A-208	ENST00000445108	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID4A-208	ENST00000445108	MGP	P08493	103 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ARID4A-208	ENST00000445108	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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