RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MDFICQ9P1T7 246 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R17O96001 155 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 FA2HQ7L5A8 372 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MRAP2Q96G30 205 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 NXPH4O95158 308 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM6P0DI80 62 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 AMTP48728 403 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF876PQ49A33 203 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 SPXQ9BT56 116 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF415Q09FC8 603 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R2P5 195 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRY2O43597 315 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF6BO95407 300 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB125Q8N687 156 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 PTH2Q96A98 100 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf57Q99622 126 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 CSTL1Q9H114 145 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 AGRNO00468 2067 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 F5H697 171 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 SMKR1H3BMG3 65 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLL1P15814 213 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS47A8MTI9 375 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 NCR2O95944 276 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 NPYP01303 97 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 MGPP08493 103 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf78Q9BR46 151 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 CUBNO60494 3623 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MWV9 139 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 SCGB1D1O95968 90 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 PYY3Q5JQD4 70 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 LEPROTL1O95214 131 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYGDP07320 174 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 JPT2Q9H910 190 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 NIT2Q9NQR4 276 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ATRQ13535 2644 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 H7C1H1 209 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 PRM2P04554 102 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTDAPP60985 99 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A12P80511 92 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RRN3P1Q2M238 152 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZWC4 215 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N8P6 123 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RASL10AQ92737 203 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01546A6NGU7 62 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EMI3 77 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 GAS8-AS1O95177 125 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 AZU1P20160 251 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 APOC4P55056 127 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF56Q15929 161 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf74Q96GX8 76 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ST20Q9HBF5 79 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RHODO00212 210 aa7.31□□□□□ -1.24
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