RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318266.9

PTPRA-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRA, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-202ENST00000318266 A4D1N5 150 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 IGHV3-30P01768 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 KLRB1Q12918 225 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ELANEP08246 267 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE5Q13069 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE6Q13070 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 LY6DQ14210 128 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 Q8N9W7 124 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 SNCGO76070 127 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE2BQ13066 116 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE2EQ4V326 116 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ODF3BA8MYP8 253 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 SRD5A1P18405 259 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 CCDC179H3BU77 68 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 TIMD4Q96H15 378 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 J3QQQ9 107 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 PMVKQ15126 192 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF580Q9UK33 172 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 TMEM219Q86XT9 240 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 GPHB5Q86YW7 130 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 CREBBPQ92793 2442 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 SORL1Q92673 2214 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 TMEM262E9PQX1 116 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 TTC32Q5I0X7 151 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 Q8N6K4 173 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRA-202ENST00000318266 MUC4Q99102 2169 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 TRBV12-3P01733 135 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 NPC2P61916 151 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 C3orf56Q8N813 242 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 IGIPA6NJ69 53 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 Q8N1Y9 231 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 VCX2Q9H322 139 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 ITPR1Q14643 2758 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 PRSS2P07478 247 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 CITED1Q99966 193 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 IGHV3-11P01762 117 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 IGHV3-33P01772 117 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 Q8NA96 180 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 M0R1W7 72 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 RHODO00212 210 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 IGKV3-20P01619 116 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 AMELXQ99217 191 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 Q6ZSV7 163 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE12JA6NER3 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE7O76087 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE12FP0CL80 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE12GP0CL81 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE12IP0CL82 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 IFITM1P13164 125 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 SAA4P35542 130 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 GAGE4Q13068 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 LINC01620Q4KN68 170 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 LINC00477Q96M19 166 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF56Q15929 161 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 A0A0J9YXV3 536 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRA-202ENST00000318266 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms