RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.33□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 A4D1N5 150 aa7.33□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 G3V4G9 280 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 MSMBP08118 114 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 DAND5Q8N907 189 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 PDE6GP18545 87 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 A0A0J9YY99 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 IGHV1-69P01742 117 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 GYPEP15421 78 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 WFDC2Q14508 124 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 RNF144BQ7Z419 303 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 K7EQD1 137 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 NCR3O14931 201 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 CLEC2BQ92478 149 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 CASC2Q6XLA1 102 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 RNF152Q8N8N0 203 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 POLQO75417 2590 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 C5orf38Q86SI9 138 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 GNRH2O43555 120 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 Q8TCH9 128 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 WT1-ASQ06250 92 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 Q6ZUT4 128 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 HIGD1BQ9P298 99 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 RNF223E7ERA6 249 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 TEX22C9J3V5 150 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 FAM236CP0DP71 79 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 USP17L23D6RBM5 183 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 FXYD2P54710 66 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 LTBP1Q14766 1721 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 K7EM74 188 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 C16orf74Q96GX8 76 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 LECT2O14960 151 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 NDUFA1O15239 70 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 CXCL5P42830 114 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 E7EQL1 145 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 H3BT86 120 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 GNLYP22749 145 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 Q0VFX4 171 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 DIRC1Q969H9 104 aa7.27□□□□□ -1.24
TNS1-201ENST00000171887 ARTNQ5T4W7 220 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 MLST8Q9BVC4 326 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 LYPD6Q86Y78 171 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 UQCRQO14949 82 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 LMO1P25800 156 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 WISP1O95388 367 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 LINC00643Q86TS7 51 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 J3QLI3 93 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 COL4A5P29400 1685 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 TDRG1Q3Y452 100 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 BPY2O14599 106 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 TOMM6Q96B49 74 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 H3BUA1 57 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 LINC00311Q8N616 119 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 B9D2Q9BPU9 175 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 JMJD1CQ15652 2540 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS1-201ENST00000171887 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.7 ms