RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.43	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	RS1	O15537	224 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	NXPH4	O95158	308 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRIP1	P50238	77 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.42	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035		A8MWV9	139 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SULT1A2	P50226	295 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.41	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		11.4	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.4	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.4	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BVH4	76 aa		11.4	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.4	□□□□□ -0.58
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFNA1	P01562	189 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCL20	P78556	96 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHOH	Q15669	191 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.39	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.38	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		11.38	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.37	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GVY2	172 aa		11.37	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.36	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.36	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.36	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARL	Q9H300	379 aa		11.36	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.36	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0R381	172 aa		11.35	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	EVI2A	P22794	236 aa		11.35	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNP2	Q05952	138 aa		11.35	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.35	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHOD	O00212	210 aa		11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE6D	O43924	150 aa		11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.34	□□□□□ -0.59
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.33	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.33	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	JPT2	Q9H910	190 aa		11.33	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.33	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.33	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.33	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035		K7EP13	123 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIRAP	P58753	221 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00315	P59091	139 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DERL1	Q9BUN8	251 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.32	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXCL1	P09341	107 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCL2	P10415	239 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNG4	P50150	75 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.31	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WWL8	130 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE1	Q13065	139 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE4	Q13068	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE5	Q13069	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZSN1	163 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.3	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.29	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.29	□□□□□ -0.6
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRYGD	P07320	174 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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