RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 F8VRH5 84 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 C16orf54Q6UWD8 224 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM243Q9BU79 118 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 VWC2LB2RUY7 222 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FANCD2OSQ96PS1 177 aa16.05■□□□□ 0.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2V1Q13404 147 aa16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 LEPROTO15243 131 aa16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 C19orf84I3L1E1 186 aa16.03■□□□□ 0.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 DKK2Q9UBU2 259 aa16.02■□□□□ 0.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 COX11Q9Y6N1 276 aa16.01■□□□□ 0.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 KLF12Q9Y4X4 402 aa16■□□□□ 0.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF124Q15973 351 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF503Q96F45 646 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TRBV12-3P01733 135 aa15.95■□□□□ 0.14
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PTPRJ-208ENST00000615445 A6NDX4 124 aa15.93■□□□□ 0.14
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PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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PTPRJ-208ENST00000615445 K7EMI3 77 aa15.92■□□□□ 0.14
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PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00173Q6ZV60 143 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SUMO4Q6EEV6 95 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NXPH4O95158 308 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0J9YY99 117 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8N1Y9 231 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRJ-208ENST00000615445 SPINK8P0C7L1 97 aa15.89■□□□□ 0.13
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