RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf70A6NJV1 201 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 TRGV9Q99603 122 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 TCRAP04437 139 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MWL6 223 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 LYZP61626 148 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 BAALCQ8WXS3 180 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 ERG28Q9UKR5 140 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 LTAP01374 205 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 FMC1Q96HJ9 113 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 USMG5Q96IX5 58 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 CT83Q5H943 113 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM223BA6NKX1 122 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BUA1 57 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 Q86TA4 180 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 PRNTQ86SH4 94 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4C46A6NHA9 309 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EIM0 57 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 CHEK1O14757 476 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLC1P0CG04 106 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF138P52744 262 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF492Q9P255 531 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD52Q0P140 79 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 F8W735 103 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 LEPROTL1O95214 131 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 CSN3P07498 182 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 OTORQ9NRC9 128 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 hDV102S1A0JD36 115 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV2-11P01706 119 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 C17orf77Q96MU5 243 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 TENM2Q9NT68 2774 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV1-17P01599 117 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 CD7P09564 240 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM213A2RRL7 107 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 I3L2K1 104 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV1-51P01701 117 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSGP08311 255 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 V9GYY9 64 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM231BA6NCW3 169 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 IL17DQ8TAD2 202 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 MPV17L2Q567V2 206 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GUT8 65 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 M0R3E3 92 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms