RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595194.1

GTPBP3-208, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GTPBP3-208	ENST00000595194	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP3-208	ENST00000595194	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP3-208	ENST00000595194	IFNA7	P01567	189 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP3-208	ENST00000595194	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GTPBP3-208	ENST00000595194	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	UBE2G2	P60604	165 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	FAT1	Q14517	4588 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	PEX7	O00628	323 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	LELP1	Q5T871	98 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	FAM74A7	A6NL05	159 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	PSCA	O43653	123 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	XG	P55808	180 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194		A8MWV9	139 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194		G3V3Q6	166 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	ASIP	P42127	132 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194		Q6ZSN1	163 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194		Q86TA4	180 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	PARL	Q9H300	379 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	EPM2A	B3EWF7	344 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194		B4DEV8	164 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	ARPC5	O15511	151 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194		Q9HAA7	133 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	GCSH	P23434	173 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	CRIP1	P50238	77 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	JPT2	Q9H910	190 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194		H3BVH4	76 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	GAGE1	Q13065	139 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	GAGE4	Q13068	117 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	GAGE5	Q13069	117 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	RGS21	Q2M5E4	152 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194		M0R036	132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	SH2D1A	O60880	128 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	UBE2G1	P62253	170 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	LAGE3	Q14657	143 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194		Q9UF83	564 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-208	ENST00000595194	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	FHIT	P49789	147 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	RHOD	O00212	210 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194		Q8N3U1	123 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194		Q8N814	137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	LTA	P01374	205 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP3-208	ENST00000595194	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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