RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RS1O15537 224 aa17.02■□□□□ 0.32
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG5P63218 68 aa17.02■□□□□ 0.32
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM74A1Q5RGS3 127 aa17.02■□□□□ 0.32
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZSA8 131 aa17.01■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8N3U1 123 aa17.01■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM3Q9BZL3 60 aa17.01■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LAGE3Q14657 143 aa17■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC51BQ86UW2 128 aa17■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SGK494Q96LW2 274 aa17■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf21Q9P2W6 132 aa17■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00528Q8N1L1 170 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 SCGB1C1Q8TD33 95 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa16.98■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 CIDEAO60543 219 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PQLC2Q6ZP29 291 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf85Q96MD7 179 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TM2D2Q9BX73 214 aa16.97■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 LECT2O14960 151 aa16.96■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM75Q8N9X5 138 aa16.96■□□□□ 0.31
CAPNS1-211ENST00000590874 PGPEP1LA6NFU8 196 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB2AP61019 212 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF506Q5JVG8 444 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 STOML3Q8TAV4 291 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 WFDC1Q9HC57 220 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPV4 95 aa16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MGST1P10620 155 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 IFITM2Q01629 132 aa16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 NDFIP1Q9BT67 221 aa16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TPT1P13693 172 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PTH2Q96A98 100 aa16.92■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 GCGP01275 180 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA7P01567 189 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00694P0DN24 101 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01620Q4KN68 170 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX261Q6UWH6 196 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRAP04437 139 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL14EPLP0DKL9 152 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE12JA6NER3 117 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE1Q13065 139 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE4Q13068 117 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE5Q13069 117 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE13Q4V321 117 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10G9Q8NGN4 311 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10G7Q8NGN6 311 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PARLQ9H300 379 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG8Q9UQ74 426 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV2-11P01706 119 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SCXQ7RTU7 201 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf17Q8NAS9 161 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 BAALCQ8WXS3 180 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 Q9UF83 564 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HMCN2Q8NDA2 5059 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SMUG1Q53HV7 270 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PRNTQ86SH4 94 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 STAG3L2P0CL84 134 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 STAG3L3P0CL85 134 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TOR2AQ5JU69 321 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP2Q6ZN57 461 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC30Q96LL9 226 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GGTLC3B5MD39 225 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EQM0 130 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SUN5Q8TC36 379 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD10Q9BYL1 202 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MWV9 139 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GCHFRP30047 84 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00479Q96M42 142 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 JPT2Q9H910 190 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 EPDR1Q9UM22 224 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC11BP0C7V7 166 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 UFSP1Q6NVU6 142 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKAL2Q6UX46 152 aa16.81■□□□□ 0.28
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