RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 LINC01620Q4KN68 170 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 K7EIM0 57 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 ICOSQ9Y6W8 199 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZQT7 251 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZSR3 168 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 PSMB8P28062 276 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 APRG1Q8IVJ8 170 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 PIP4P1Q86T03 277 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 A4D1N5 150 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 CGB3P0DN86 165 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 MUSTN1Q8IVN3 82 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 HERV-K104P63124 156 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 RNF138Q8WVD3 245 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 HIGD1BQ9P298 99 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 CCL24O00175 119 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 SLURP1P55000 103 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 WT1P19544 449 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP2Q6ZN57 461 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRM-211ENST00000580170 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1-17P01599 117 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 CTSGP08311 255 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 AJUBAQ96IF1 538 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 LYPD6Q86Y78 171 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 GTSF1Q8WW33 167 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf38Q86SI9 138 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB105AQ8NG35 78 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf54Q6UWD8 224 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 BRK1Q8WUW1 75 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 K7EQD1 137 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 RNF183Q96D59 192 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 TTTY13Q9BZ97 58 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFS5O43920 106 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV2-23P01705 113 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0J9YXV3 536 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 BUB3O43684 328 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 H0YGX0 51 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 ROS1P08922 2347 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 SVIPQ8NHG7 77 aa16.52■□□□□ 0.24
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PTPRM-211ENST00000580170 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 PRAC2D3DTV9 90 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf74Q96GX8 76 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV2-14P01704 120 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 CGB7P0DN87 165 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 BLCAPP62952 87 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 DOCK7Q96N67 2140 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 CRYGBP07316 175 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 PKDREJQ9NTG1 2253 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 RNF152Q8N8N0 203 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA1O95477 2261 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N9W7 124 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 TEX22C9J3V5 150 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 GYPEP15421 78 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 J3QKU1 62 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2BP63146 152 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 USF3Q68DE3 2245 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 Q9HAA7 133 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 BAALCQ8WXS3 180 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 TOMM6Q96B49 74 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 DENND4CQ5VZ89 1909 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 PTH2Q96A98 100 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 NCOR1O75376 2440 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.47■□□□□ 0.23
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