RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		14.31	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		14.31	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		14.31	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	NXPH4	O95158	308 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	AKR1C3	P42330	323 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	UBE2G1	P62253	170 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	TNP2	Q05952	138 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	PTH2	Q96A98	100 aa		14.3	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	C1QB	P02746	253 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		14.29	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996		B4DEV8	164 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996		M0R036	132 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	ORM1	P02763	201 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	SRI	P30626	198 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	TTC32	Q5I0X7	151 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		14.28	□□□□□ -0.12
CS-222	ENST00000550996	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	ASIP	P42127	132 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	SIVA1	O15304	175 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	14.26	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PPQ1	181 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996		H3BVH4	76 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996		Q6ZSN1	163 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	JPT2	Q9H910	190 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	IL36B	Q9NZH7	164 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	SULT1A2	P50226	295 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	RAB5C	P51148	216 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	LINC01559	Q495D7	138 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	MLST8	Q9BVC4	326 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	GNG13	Q9P2W3	67 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	AKAP14	Q86UN6	197 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	SLC51B	Q86UW2	128 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	PARL	Q9H300	379 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	RYR1	P21817	5038 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	DERL1	Q9BUN8	251 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	CIDEA	O60543	219 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	LINC00315	P59091	139 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	BAGE2	Q86Y30	109 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	C11orf52	Q96A22	123 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-222	ENST00000550996	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	RHOH	Q15669	191 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996		Q9UF83	564 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	HSPG2	P98160	4391 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996		A8MWV9	139 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	TIRAP	P58753	221 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GVG6	124 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	LINC00694	P0DN24	101 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	IGLV2-8	P01709	118 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	PRR27	Q6MZM9	219 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	SYT8	Q8NBV8	401 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		14.15	□□□□□ -0.14
CS-222	ENST00000550996		A0A087WWL8	130 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996		M0R381	172 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	CRYGD	P07320	174 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	CENPW	Q5EE01	88 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	SFRP2	Q96HF1	295 aa		14.14	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	RAB19	A4D1S5	217 aa		14.13	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	TEX46	H3BTG2	121 aa		14.13	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	BCL2	P10415	239 aa		14.13	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	GAGE12J	A6NER3	117 aa		14.12	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	CXCL1	P09341	107 aa		14.12	□□□□□ -0.15
CS-222	ENST00000550996	MED14OS	P0DP75	135 aa		14.12	□□□□□ -0.15

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