RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5I1	Q13606	314 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPW	Q5EE01	88 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TOR2A	Q5JU69	321 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM210A	Q96ND0	272 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MLST8	Q9BVC4	326 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR27	Q6MZM9	219 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RASL10A	Q92737	203 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	UPK3B	Q9BT76	320 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DERL1	Q9BUN8	251 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R036	132 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CRIP1	P50238	77 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CEBPG	P53567	150 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPQ1	181 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB19	A4D1S5	217 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA5	P20719	270 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PEA15	Q15121	130 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01559	Q495D7	138 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT8	Q8NBV8	401 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HERC2	O95714	4834 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	XKRY2	A2RUG3	117 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		C9JCJ5	164 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CIDEA	O60543	219 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF876P	Q49A33	203 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC32	Q5I0X7	151 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PTH2	Q96A98	100 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IL36B	Q9NZH7	164 aa		12	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PARL	Q9H300	379 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		Q9H8V8	135 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC4	Q99102	2169 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		P01737	135 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-53	P01767	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL1	P09341	107 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PRO0255	Q9UI72	69 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BVH4	76 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PKHD1	P08F94	4074 aa		11.96	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MWV9	139 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PAX4	O43316	350 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ESRG	Q1W209	222 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PKD1	P98161	4303 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A096LPF7	62 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0J9YY99	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	OCC1	Q8TAD7	63 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EP13	123 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RS1	O15537	224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	FHL2	Q14192	279 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R381	172 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYBA4	P53673	196 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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