RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 K7EQD1 137 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 M0R036 132 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 RS1O15537 224 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 CIDEAO60543 219 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ASIPP42127 132 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ZNF575Q86XF7 245 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 BAGE2Q86Y30 109 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 MLST8Q9BVC4 326 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 MANBALQ9NQG1 85 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 GYPEP15421 78 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 LINC01559Q495D7 138 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 DNLZQ5SXM8 178 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 IL36BQ9NZH7 164 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 NACAE9PAV3 2078 aa6.3□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 H3BVH4 76 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 SRIP30626 198 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 C11orf52Q96A22 123 aa6.29□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 A8MWV9 139 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 IFNA1P01562 189 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 C6orf223Q8N319 242 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 DERL1Q9BUN8 251 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 PARLQ9H300 379 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 JPT2Q9H910 190 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.28□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 MUC4Q99102 2169 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GVY2 172 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PPQ1 181 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SIVA1O15304 175 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 PDE6DO43924 150 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 NXPH4O95158 308 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 RHOHQ15669 191 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TTC32Q5I0X7 151 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 PRR27Q6MZM9 219 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZSN1 163 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SYT8Q8NBV8 401 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 VAX2Q9UIW0 290 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.27□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 RAB19A4D1S5 217 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 IGLV2-8P01709 118 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 BCL2P10415 239 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 BLOC1S1P78537 153 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 CENPWQ5EE01 88 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SFRP2Q96HF1 295 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 MED9Q9NWA0 146 aa6.26□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 M0R381 172 aa6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 CRYGDP07320 174 aa6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 CXCL1P09341 107 aa6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 MED14OSP0DP75 135 aa6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 GNG4P50150 75 aa6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TNP2Q05952 138 aa6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 ZFP82Q8N141 532 aa6.25□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WWL8 130 aa6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TIRAPP58753 221 aa6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SMIM12Q96EX1 92 aa6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.24□□□□□ -1.41
SYN3-211ENST00000472027 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.23□□□□□ -1.41
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