RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880		H3BVH4	76 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880		K7EQD1	137 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	C1QB	P02746	253 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf85	Q96MD7	179 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SSR4-208	ENST00000471880	SIVA1	O15304	175 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	PRR27	Q6MZM9	219 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	UPK3B	Q9BT76	320 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	RS1	O15537	224 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	LTA	P01374	205 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	CRIP1	P50238	77 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	RAB5C	P51148	216 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	SYT8	Q8NBV8	401 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GVY2	172 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	CCL20	P78556	96 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	SLC51B	Q86UW2	128 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	BAGE2	Q86Y30	109 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	HERC2	O95714	4834 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880		M0R381	172 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA1	P01562	189 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	SULT1A2	P50226	295 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	TNP2	Q05952	138 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880		A8MWV9	139 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	RHOH	Q15669	191 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	IL36B	Q9NZH7	164 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	PKD1	P98161	4303 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	CIDEA	O60543	219 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	SST	P61278	116 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	PARL	Q9H300	379 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	JPT2	Q9H910	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPQ1	181 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	PTH2	Q96A98	100 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	DERL1	Q9BUN8	251 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WWL8	130 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE12J	A6NER3	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	EVI2A	P22794	236 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00315	P59091	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE1	Q13065	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE4	Q13068	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE5	Q13069	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE13	Q4V321	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP82	Q8N141	532 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	MED9	Q9NWA0	146 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	RHOD	O00212	210 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	GNG4	P50150	75 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZSN1	163 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	TPPP3	Q9BW30	176 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	RAB19	A4D1S5	217 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	PDE6D	O43924	150 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	BCL2	P10415	239 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GVG6	124 aa		10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 264.8 ms