RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 A8MWL6 223 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 SPINK4O60575 86 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP6V1G1O75348 118 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 MT-ND4LP03901 98 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ASIPP42127 132 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 EMP1P54849 157 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF415Q09FC8 603 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 C18orf15Q96N68 181 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 TGP01266 2768 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 XKRY2A2RUG3 117 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 CXorf65A6NEN9 183 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 SNURFLB1AK76 121 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 H3BVH4 76 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB4AO15263 64 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 SNAPINO95295 136 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 GZMBP10144 247 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR73Q6P4I2 378 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 RASL10AQ92737 203 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 IMMP2LQ96T52 175 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 SPXQ9BT56 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 LYRM9A8MSI8 78 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 HIGD1CA8MV81 97 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 MUC7Q8TAX7 377 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 YPEL4Q96NS1 127 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 DKK2Q9UBU2 259 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 F2Z2F3 143 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 M0R2P5 195 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 S100A1P23297 94 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 NUP35Q8NFH5 326 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 CELA1Q9UNI1 258 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GXF2 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 C3orf84H3BNL1 204 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 DAD1P61803 113 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 CACNG7P62955 275 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZTI0 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFP82Q8N141 532 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 GATD1Q8NB37 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 NUPR2A6NF83 97 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF876PQ49A33 203 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-207ENST00000454947 NACAE9PAV3 2078 aa6.65□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GUT8 65 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 RS1O15537 224 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00315P59091 139 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GW15 77 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 CRYGDP07320 174 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB130BP0DP73 79 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB130AP0DP74 79 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 C12orf74Q32Q52 190 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 SYT8Q8NBV8 401 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE12BA1L429 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 A8MWV9 139 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 M0R381 172 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE7O76087 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE12FP0CL80 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE12GP0CL81 117 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.7 ms