RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 EVI2AP22794 236 aa20■□□□□ 0.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 CTSGP08311 255 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa19.92■□□□□ 0.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 C18orf65Q6ZTR6 163 aa19.9■□□□□ 0.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa19.88■□□□□ 0.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 SAP30O75446 220 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa19.87■□□□□ 0.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 NOTCH3Q9UM47 2321 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFAND3Q9H8U3 227 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 GCSHP23434 173 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-23P01764 117 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DMBP28068 263 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-201ENST00000246533 LAGE3Q14657 143 aa19.85■□□□□ 0.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB8P28062 276 aa19.84■□□□□ 0.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV1-40P01703 118 aa19.83■□□□□ 0.77
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa19.82■□□□□ 0.76
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CAPNS1-201ENST00000246533 TCTAP57738 103 aa19.82■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf32Q32M92 178 aa19.82■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MRAP2Q96G30 205 aa19.82■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0BQ99437 205 aa19.82■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01619G3V211 115 aa19.81■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PF4V1P10720 104 aa19.81■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa19.81■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA11Q86Y39 141 aa19.81■□□□□ 0.76
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