RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 FMC1Q96HJ9 113 aa14.9□□□□□ -0.02
NME4-201ENST00000219479 C9orf85Q96MD7 179 aa14.9□□□□□ -0.02
NME4-201ENST00000219479 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.89□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 CIDEAO60543 219 aa14.89□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 ASIPP42127 132 aa14.89□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.89□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.89□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 A0A1B0GV50 99 aa14.88□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 B4DEV8 164 aa14.88□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 RS1O15537 224 aa14.88□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 LINC00315P59091 139 aa14.88□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.88□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.88□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.88□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.87□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.87□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 PAGE4O60829 102 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 AKR1C3P42330 323 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 RHOHQ15669 191 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 PTH2Q96A98 100 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.86□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 M0R036 132 aa14.85□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 EVI2AP22794 236 aa14.85□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.85□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.84□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 SH2D1AO60880 128 aa14.84□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 TMUB2Q71RG4 321 aa14.84□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.84□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.84□□□□□ -0.03
NME4-201ENST00000219479 A8MWV9 139 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 H3BVH4 76 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.83□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 K7EP13 123 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 LTAP01374 205 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 NFE4Q86UQ8 179 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 Q8N1X5 172 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 SYT8Q8NBV8 401 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 IL36BQ9NZH7 164 aa14.82□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 CRIP1P50238 77 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.81□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 HERC1Q15751 4861 aa14.8□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.8□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 EREGO14944 169 aa14.8□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 TIRAPP58753 221 aa14.8□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 CRYGDP07320 174 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 PARLQ9H300 379 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-201ENST00000219479 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 ERVFC1-1P60608 527 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 LINC01559Q495D7 138 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 TEX46H3BTG2 121 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 RAB5CP51148 216 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 DNLZQ5SXM8 178 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 M0R381 172 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 RHODO00212 210 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 BAGE2Q86Y30 109 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 JPT2Q9H910 190 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 MANBALQ9NQG1 85 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 GNG13Q9P2W3 67 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 GAGE12JA6NER3 117 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 KRTAP10-2P60368 255 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 GAGE1Q13065 139 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 GAGE4Q13068 117 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 GAGE5Q13069 117 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 GAGE13Q4V321 117 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-201ENST00000219479 LELP1Q5T871 98 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms