RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	HBD	P02042	147 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	G0S2	P27469	103 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CDKN1B	P46527	198 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SST	P61278	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	DUX5	Q96PT3	197 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	PRO1933	Q9H354	126 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	C16orf95	Q9H693	158 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	PTPN13	Q12923	2485 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01549	A6NIU2	74 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		H3BVH4	76 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF688	P0C7X2	276 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SRD5A1	P18405	259 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TFPI2	P48307	235 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		Q6ZSV7	163 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	POLQ	O75417	2590 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	APC	P25054	2843 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		J3KRW8	73 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TNFRSF6B	O95407	300 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TDRG1	Q3Y452	100 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA45	Q537H7	98 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	FBN2	P35556	2912 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CHD6	Q8TD26	2715 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	PRSS47	A8MTI9	375 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		F6UB75	175 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		M0R381	172 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CD7	P09564	240 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SLURP1	P55000	103 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	HILS1	P60008	231 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	MUC21	Q5SSG8	566 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB125	Q8N687	156 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		Q8N8P6	123 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	RAX2	Q96IS3	184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	C20orf78	Q9BR46	151 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TENM4	Q6N022	2769 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01546	A6NGU7	62 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFA7	O95182	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	NPY	P01303	97 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	HLA-DRB4	P13762	266 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	EVI2A	P22794	236 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	PRR9	Q5T870	116 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	RNF185	Q96GF1	192 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ITPR3	Q14573	2671 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501		M0R143	59 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CCL24	O00175	119 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	TCAP	O15273	167 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ATP5L	O75964	103 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	NXPH4	O95158	308 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	NCR2	O95944	276 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CD33	P20138	364 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	FCER1G	P30273	86 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	LAGE3	Q14657	143 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB136	Q30KP8	78 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF747	Q9BV97	191 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PNKP-231	ENST00000640501	SMKR1	H3BMG3	65 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PNKP-231	ENST00000640501	MGP	P08493	103 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB131A	P59861	70 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PNKP-231	ENST00000640501	CTAG1A	P78358	180 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PNKP-231	ENST00000640501	FHL3	Q13643	280 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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