RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637667.1

CLN6-222, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, human

TSL 1 (best)

Gene CLN6, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN6-222	ENST00000637667	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	TYMS	P04818	313 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667		C9JCJ5	164 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	SGK494	Q96LW2	274 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CLN6-222	ENST00000637667	EREG	O14944	169 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	GCHFR	P30047	84 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667		Q8N1X5	172 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	MED28	Q9H204	178 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667		K7EP13	123 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	PTTG1	O95997	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	MB	P02144	154 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	TCRA	P04437	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667		K7EQM0	130 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	EVI2A	P22794	236 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	SERF2	P84101	59 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	PSG8	Q9UQ74	426 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	TAAR5	O14804	337 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	CXorf1	O96002	111 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	TIRAP	P58753	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667		Q5BKY6	102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667		A0A087WTM6	91 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	GCG	P01275	180 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	ZNF876P	Q49A33	203 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-222	ENST00000637667	CRYGD	P07320	174 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	RS1	O15537	224 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	PPT1	P50897	306 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	ZFP69	Q49AA0	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	CIDEA	O60543	219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	RHOH	Q15669	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	PTH2	Q96A98	100 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667		A0A1W2PRE2	83 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN6-222	ENST00000637667	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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