RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.19■□□□□ 0.18
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PTPRJ-208ENST00000615445 P0C879 139 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CST9LQ9H4G1 147 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 C20orf78Q9BR46 151 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 HLA-DRB4P13762 266 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRJ-208ENST00000615445 SNHG12Q9BXW3 62 aa16.07■□□□□ 0.16
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