RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TMEM213A2RRL7 107 aa11.69□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 PCP2Q8IVA1 136 aa11.69□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.68□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GXF2 115 aa11.68□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 FXYD2P54710 66 aa11.68□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZQT7 251 aa11.68□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 SIRPDQ9H106 197 aa11.68□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.68□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 DUX5Q96PT3 197 aa11.68□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 CDIP1Q9H305 208 aa11.67□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.67□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.66□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 SMKR1H3BMG3 65 aa11.66□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 TIRAPP58753 221 aa11.66□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 IGHV4-39P01824 125 aa11.66□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 C5orf47Q569G3 176 aa11.66□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.66□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.65□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 Q6ZUT4 128 aa11.65□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 LINC01545Q5VT33 79 aa11.65□□□□□ -0.54
CTIF-205ENST00000587860 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.65□□□□□ -0.54
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CTIF-205ENST00000587860 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.64□□□□□ -0.55
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CTIF-205ENST00000587860 Q8N6K4 173 aa11.64□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.64□□□□□ -0.55
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CTIF-205ENST00000587860 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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CTIF-205ENST00000587860 Q6ZS46 218 aa11.63□□□□□ -0.55
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CTIF-205ENST00000587860 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 FOXI1Q12951 378 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.6□□□□□ -0.55
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CTIF-205ENST00000587860 TEX29Q8N6K0 151 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 D6R8Y8 96 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 SFTA2Q6UW10 78 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-205ENST00000587860 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.59□□□□□ -0.55
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