RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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CS-222ENST00000550996 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.46□□□□□ -0.09
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CS-222ENST00000550996 BCL2L11O43521 198 aa14.45□□□□□ -0.1
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CS-222ENST00000550996 HERC2O95714 4834 aa14.43□□□□□ -0.1
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CS-222ENST00000550996 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.39□□□□□ -0.11
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CS-222ENST00000550996 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 UPK3BQ9BT76 320 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
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CS-222ENST00000550996 ZFP69Q49AA0 526 aa14.37□□□□□ -0.11
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CS-222ENST00000550996 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.36□□□□□ -0.11
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CS-222ENST00000550996 PAGE4O60829 102 aa14.36□□□□□ -0.11
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CS-222ENST00000550996 CRIP1P50238 77 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 PPT1P50897 306 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 SLAQ13239 276 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 CST9LP1Q5W188 147 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-222ENST00000550996 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.36□□□□□ -0.11
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CS-222ENST00000550996 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.34□□□□□ -0.11
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CS-222ENST00000550996 C9JCJ5 164 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 K7EQD1 137 aa14.33□□□□□ -0.12
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CS-222ENST00000550996 ZNF876PQ49A33 203 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.32□□□□□ -0.12
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CS-222ENST00000550996 GYPEP15421 78 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 ZNF575Q86XF7 245 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 C6orf223Q8N319 242 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 FMC1Q96HJ9 113 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 RS1O15537 224 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 SH2D1AO60880 128 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 LTAP01374 205 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 CCL20P78556 96 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-222ENST00000550996 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.31□□□□□ -0.12
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