RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	GCG	P01275	180 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV2-11	P01706	119 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL20	P78556	96 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR9	Q5T870	116 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00479	Q96M42	142 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	NAGK	Q9UJ70	344 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF415	Q09FC8	603 aa		12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC21	Q5SSG8	566 aa		12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TVP23C	Q96ET8	276 aa		12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	VAX2	Q9UIW0	290 aa		12.16	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB130B	P0DP73	79 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB130A	P0DP74	79 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	HTN3	P15516	51 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZR54	194 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424		Q86TA4	180 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	C18orf15	Q96N68	181 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf49	Q96NF6	230 aa		12.15	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BNG1	76 aa		12.14	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL2	P10415	239 aa		12.14	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		12.14	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		12.13	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRG1	Q3Y452	100 aa		12.13	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		12.13	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		12.13	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424		F5H768	121 aa		12.12	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TCL1A	P56279	114 aa		12.12	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX261	Q6UWH6	196 aa		12.12	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	BAGE2	Q86Y30	109 aa		12.12	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SPX	Q9BT56	116 aa		12.12	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	LTA	P01374	205 aa		12.11	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		12.11	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		12.11	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	MED9	Q9NWA0	146 aa		12.11	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		12.11	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE12B	A1L429	117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE7	O76087	117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ORM1	P02763	201 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE12F	P0CL80	117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE12G	P0CL81	117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE12I	P0CL82	117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL18	P55774	89 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZQT7	251 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf52	Q96A22	123 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH2	Q9P225	4427 aa		12.08	□□□□□ -0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL8C	O15255	209 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	GNRH2	O43555	120 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINK4	O60575	86 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	BIN3	Q9NQY0	253 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GVY2	172 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		B4DEV8	164 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TYMS	P04818	313 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG4	P50150	75 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM12	Q96EX1	92 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NACA	E9PAV3	2078 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R2P5	195 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB14	P61106	215 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZTI0	123 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM250	H0YL14	139 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D1A	O60880	128 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT3	O95989	172 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ASIP	P42127	132 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R2N4	97 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SLA	Q13239	276 aa		12.04	□□□□□ -0.48

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