RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484658.1

RAB3GAP2-208, Transcript of RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2, human

TSL 4

Gene RAB3GAP2, Length 515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ELOB	Q15370	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A087WWC5	75 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		H7C1H1	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		M0R3E3	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TBP	P20226	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TGFBR1	P36897	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CD3D	P04234	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IAPP	P10997	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RAB31	Q13636	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q8TAT8	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MED6	O75586	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	INPP1	P49441	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF266	Q14584	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NEDD8	Q15843	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRR4	Q16378	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q6AWC8	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SYNGR2	O43760	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	APOA1	P02647	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC25A6	P12236	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A087WX48	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	WRB	O00258	174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CTDSPL	O15194	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AMT	P48728	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF138	P52744	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PDE6H	Q13956	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q9H521	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PGP	A6NDG6	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GNRH2	O43555	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RAB3D	O95716	219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TAS2R19	P59542	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GAGE1	Q13065	139 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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