RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	LCA10	Q71F78	164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	BANF2	Q9H503	90 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	DYSF	O75923	2080 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	FREM3	P0C091	2139 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105		A8MWV9	139 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	IGLL5	B9A064	214 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	LY6L	H3BQJ8	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	NAPSA	O96009	420 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	CD2	P06729	351 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ELK1	P19419	428 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	DAP	P51397	102 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	SVBP	Q8N300	66 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	RPRM	Q9NS64	109 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	CA10	Q9NS85	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ODAM	A1E959	279 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	PIN1P1	O15428	100 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	NDUFB3	O43676	98 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	LTA	P01374	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	IFITM1	P13164	125 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ETV6	P41212	452 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF117	Q03924	483 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	SCX	Q7RTU7	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	OR4A5	Q8NH83	315 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF799	Q96GE5	643 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	DPY30	Q9C005	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	TG	P01266	2768 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	PLA2G10	O15496	165 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	PYY	P10082	97 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	HIST1H2BO	P23527	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	HIST1H2BB	P33778	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	HIST1H2BD	P58876	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	HIST1H2BC	P62807	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	SP6	Q3SY56	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	RMI2	Q96E14	147 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PUM2-208	ENST00000432105	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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