RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 PANO1I0J062 215 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 L7N2F9 121 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF253O75346 499 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 SRPXP78539 464 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 RAB19A4D1S5 217 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 TEX46H3BTG2 121 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 SSNA1O43805 119 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 SNAPINO95295 136 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 MUC21Q5SSG8 566 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 PRRT1Q99946 306 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 GGTLC3B5MD39 225 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 NDUFB6O95139 128 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 NDUFB4O95168 129 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF345Q14585 488 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 TMUB2Q71RG4 321 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF492Q9P255 531 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0D9SG52 128 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 FNDC10F2Z333 226 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 GOSR2O14653 212 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 AGPAT2O15120 278 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 COX7A2P2O60397 106 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 AKAIN1P0CW23 69 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP10-8P60410 259 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF546Q86UE3 836 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-209ENST00000428450 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 ID3Q02535 119 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 VWC2Q2TAL6 325 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 RMI2Q96E14 147 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 PSENENQ9NZ42 101 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 M0R2P5 195 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 MGST2Q99735 147 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 BIN3Q9NQY0 253 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0J9YXV3 536 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 F8W036 122 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF266Q14584 549 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 RHOHQ15669 191 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 Q8TAT8 98 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 GNRH2O43555 120 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 S100A8P05109 93 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF138P52744 262 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 ARL16Q0P5N6 197 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 PDE6HQ13956 83 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 C14orf177Q52M58 125 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 Q6AWC8 147 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM8Q96KF7 97 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 HOXB5P09067 269 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 OR10J4P0C629 311 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM6P0DI80 62 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-209ENST00000428450 SVBPQ8N300 66 aa7.29□□□□□ -1.24
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